河海大学工程管理研究所成立于1995年，王卓甫教授担任所长至今。经过近20年的发展，现已形成由教授、副教授、讲师、兼职研究人员，以及博士后、博士生和硕士生组成的研究团队。现有固定研究人员7人，主要研究方向包括工程风险管理、工程安全管理、工程交易管理、工程合同管理、工程投融资管理、工程设施管理和工程采砂管理等。 
       在“国际化、高层次、入主流、有特色”的发展路径和“教育、科研、咨询、培训”四轮驱动发展模式的指导下，研究所全体教师和研究生共同努力，围绕建设工程管理领域的热点难点问题，紧密结合长江三峡水利枢纽工程、黄河小浪底水利枢纽工程、广东省东深供水改造工程和南水北调工程等国家大型工程建设的管理问题开展研究，取得了一批具有代表性的研究成果，形成了良好的研究基础和较鲜明的特色。
        截至目前，研究所已承担了国家社会科学基金面上项目、国家自然科学基金青年项目、水利部公益性行业科研专项经费项目、建设部软科学项目等多项研究课题；同时，承担了水利部长委、海委、广东省水利厅、江苏水源公司、南京水利局等若干省市水利建设主管部门和大中型企业委托的建设管理咨询服务类课题几十项。先后获得省级特等奖1次，三等奖2次。已出版专著和教材10余部，包括《工程项目管理：原理与案例》等教材和《建设工程交易理论与交易模式》、《工程项目风险管理：理论、方法与应用》、《工程项目管理：模式及其创新》、《工程项目管理：理论、方法与应用》、《工程项目管理：融资理论与方法》、《工程项目管理：合同策划与履行》、《工程项目管理：计价理论与实务》、《河道采砂管理理论与实务》、《工程总承包管理理论与实务》等专著，在Journal of Construction Engineering and Management、Construction Management and Economics、Engineering, Construction and Architectural Management、Water Science and Engineering、土木工程学报、系统工程理论与实践、系统工程电子与技术、水利学报、水力发电学报等国内外重要期刊和国际会议上公开发表学术论文200余篇。
        研究所与水利部建设管理司、长委、海委，江苏、广东、江西、南水北调东线江苏水源公司等多省市水利建设主管理部门，中国水利科学研究院，以及一批工程建设单位和大型施工企业具有良好的合作基础。同时，研究所亦与美国宾夕法尼亚州立大学（The Pennsylvania State University）和伊利诺伊理工大学（Illinois Institute of Technology）、澳大利亚新兰威尔士大学（The University of New South Wales）、加拿大阿尔伯塔大学（University of Alberta）、香港科技大学等多所国际一流高校保持较密切的联系。
        自成立以来，研究所已培养博士生20余名，各类硕士研究生300余名。研究所招收管理科学与工程专业（工程管理与项目管理方向）博士后、博士生、硕士生及各类专业学位研究生（工程管理方向）。